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各种的颜色通常是由所涉及的化学元素晶体时形成的。

化学物质
不同的颜色可以由不同的化学物质。例如铁存款内置了紫水晶晶体结构紫色色调。晶体的硫内置晶体结构有一个黄色。

增长的不完美
一些颜色,比如在墨晶,来自增长的不完美。这些瑕疵改变晶体反光,从而改变颜色的外观。

光
的一部分,当观察晶体光色。当光线进入晶体其频谱分解,和它的一部分被吸收而反映其他部分。这改变了明显的水晶的颜色。